三次胎停育的原因比较多，可能是遗传因素、环境因素等非疾病因素导致的，也有可能是染色体异常、子宫畸形、母儿血型不合、感染、子宫内膜异位症、免疫功能异常以及不明原因性胚胎停止发育等情况造成。
一、非疾病因素
1.遗传因素：如果夫妻双方家族中有多次习惯性流产的情况，则可能会出现多次胎停育。建议到医院进行染色体检查，若发现存在染色体异常则需要避免再次发生胎停育的现象。
2.环境因素：如孕妇吸烟、酗酒或接触电离辐射、铅以及其他有害物质的情况下，可能会影响胎儿生长发育而导致多次胎停育的发生。
二、疾病因素
1.子宫畸形：常见于子宫纵隔或者单角子宫等患者，在怀孕后由于宫腔容积较小，可能导致受精卵着床不稳定而容易发生胎停育。
2.母儿血型不合：母亲与胎儿为ABO血型系统或者是Rh血型不同时，可引起母婴血型不合，从而影响到胎儿正常生长发育，甚至会出现胎停育。
3.感染：在孕早期受到病毒感染时，比如巨细胞病毒、风疹病毒、弓形虫病毒等病毒的感染，也可能会影响到胎儿生长发育，严重情况下会导致胎儿死亡，即表现为多次胎停育。
4.子宫内膜异位症：是指病灶局限在子宫肌层的一种良性病变，常因盆腔腹膜种植发展而来，当异位灶发生在卵巢和盆腔腹膜间时，随着病情进展，逐渐形成弥漫性腹膜炎，也可因为局部损伤、炎症等因素诱发，进而对生殖系统产生不良影响，导致不孕、反复自然流产和胎停育。