怀孕九周出现胚胎停止发育的原因比较多，可能是由于环境因素、染色体异常等原因导致。另外还可能与母体因素、父亲因素等有关。
一、外界因素
1.环境因素：如果孕妇在孕期接触了有害的物质，如铅、汞等重金属，或者长期处于电辐射环境中，可能会对胎儿生长造成影响，从而引起胚胎停止发育的情况发生。
2.感染性疾病：比如弓形虫病、风疹病毒、巨细胞病毒感染，在早期妊娠时会严重危害胎儿正常生长和发育，甚至会造成胎儿畸形或导致胚胎停止发育等情况的发生。
二、遗传因素
1.精子质量问题：男性精液质量直接关系到女性能否成功受孕以及胎儿是否能够健康发育。如果男性的精子携带的染色体有缺陷，则会导致胚胎无法继续发育而死亡。
2.卵子质量问题：若女性患有卵巢早衰、多囊卵巢综合征等疾病，会影响自身内分泌水平，进而会对胚胎着床产生不良的影响，严重者还会导致胚胎停止发育。
三、母体因素
1.全身性疾病：包括高血压、糖尿病、系统性红斑狼疮、抗磷脂抗体综合征等，这些疾病都会不同程度地影响胚胎发育，可能导致其停止发育。
2.子宫病变：比如宫腔粘连、子宫内膜息肉、子宫肌瘤等，都可直接影响胚胎着床，并且还会使其进一步发展为不全流产，所以也会出现上述情况。
3.生殖道炎症：比如支原体、衣原体感染等，没有及时治疗的情况下会影响到胚胎发育，最终导致胚胎停止发育。