如果怀孕9周出现胚胎停止发育的情况，部分孕妇可以自行流产，但并不是所有女性均会出现这种情况。在临床中引起胚胎停止发育的原因较多，主要包括遗传因素、环境因素等。
一、可能会自然流产的情况
1.孕酮水平低：通常情况下，在孕早期由黄体分泌的孕酮对维持妊娠较为重要，而当孕酮降低时可能导致子宫收缩，进而导致先兆流产或完全流产的发生。因此建议孕妇及时到医院进行检查，并遵医嘱补充孕激素，如使用地屈孕酮片治疗。
2.染色体异常：若夫妻双方有一方存在染色体异常，则可能影响胚胎质量，从而导致胚胎停止发育。此时需要进行染色体检查明确诊断，必要时可采用第三代试管婴儿技术以避免再次发生胚胎停止发育的现象。
3.母体疾病：常见的有高血压、糖尿病以及抗磷脂抗体综合征等疾病，均可导致胚胎停止发育。此外，患有系统性红斑狼疮等免疫性疾病，也可因机体产生相应的抗体而导致胚胎停止发育。对于此类情况需积极控制原发病，待病情稳定后再考虑备孕。
4.感染因素：包括病毒感染和细菌感染等，其中风疹病毒是引起胎儿畸形和胚胎停止发育的重要病因之一。弓形虫可通过胎盘引起胎儿严重损害，甚至会导致胎儿死亡。另外还有麻疹病毒、流行性感冒病毒及腮腺炎病毒等，也会增加胎儿畸形的风险或者造成胚胎停止发育。一般可在医生指导下应用更昔洛韦胶囊等药物进行抗病毒治疗，而对于已经发生的胚胎停止发育则应尽早终止妊娠。